Mobile Suit Gundam Thunderbolt

O Século Universal começou com a humanidade movendo sua crescente população para o espaço sideral. Na U.C. 0079, as colônias mais distantes da Terra, Side 3, proclamam-se o Principado de Zeon e declaram independência do governo da Federação Terrestre. A guerra foi travada. Agora, quase um ano se passou desde que a guerra eclodiu. Em um aglomerado de destroços conhecido como setor Thunderbolt, os restos de muitas colônias espaciais e navios de guerra destruídos pelo círculo de guerra. Aqui, uma luta violenta tem sido travada pelas Forças Zeon que tomaram o controle do setor e pelas Forças da Federação cuja missão é recuperá-lo…

Durante a segunda surtida do Full Armor Gundam no Setor Thunderbolt, Io mais uma vez confronta Daryl. Daryl escapa por pouco depois de jogar uma granada Cracker no Gundam, mas perde a mão esquerda no processo. Enquanto a Divisão Living Dead está desesperada para acelerar o projeto Reuse P. Device para combater o Gundam, Daryl tem sua mão direita amputada para que seu corpo tenha controle total do experimental Psycho Zaku.

A Irmandade Moore recebe reforços da Federação Terrestre, mas os novos pilotos de mobile suit são jovens adolescentes, para desgosto de Io. Sentindo a pressão da guerra, Claudia recorre às drogas antes que Io a tire de uma overdose. Io lidera os jovens cadetes para romper as defesas finais da Divisão Living Dead, mas a batalha se torna um massacre devido à inexperiência dos jovens pilotos.

Com ambos os lados sofrendo enormes baixas, o Full Armor Gundam se envolve em um confronto final com o Psycho Zaku. Enquanto isso, os membros sobreviventes da Irmandade Moore embarcam no Peixe Seco para assumi-lo, mas os membros restantes da Divisão de Mortos-Vivos se recusam a ser feitos prisioneiros e planejam autodestruir o navio junto com todos a bordo. Os sobreviventes da Federação conseguem neutralizar a tripulação de Zeon e capturar o Peixe Seco, enquanto a batalha de Io e Daryl resulta em pesados ​​danos a ambos os seus mobile suit. Uma frota de reforço de Zeon então chega e captura Io e os sobreviventes da Federação enquanto resgata todos os membros vivos restantes.

Durante o ataque da Federação Terrestre à fortaleza A Baoa Qu de Zeon, Io e seus camaradas escapam do cativeiro enquanto várias forças de Zeon recuam, levando o Gundam de Io com eles. Oito meses após o fim da Guerra de Um Ano, a Federação continua a combater os remanescentes de Zeon na Terra. O porta-aviões da Federação Spartan entra na órbita da Terra, mas uma nave da classe Musai lança sua nave Komusai para uma corrida kamikaze. De repente, um novo Gundam pilotado por Io é lançado por baixo e corta o Komusai ao meio para salvar o Spartan.

A Aliança dos Mares do Sul, uma facção cult da Federação, planeja se declarar independente. Além disso, descobre-se que eles possuem a tecnologia Reuse P. Device do Psycho Zaku de Daryl. O Spartan é designado para rastrear e destruir o Psycho Zaku antes que a South Seas Alliance possa produzir a tecnologia em massa. Na Antártica, o esquadrão de Bianca é emboscado por mobile suit de Zeon. Io faz uma surtida no Atlas Gundam e despacha as unidades inimigas antes de enfrentar uma armadura móvel Grublo. A batalha envia ambas as unidades para águas muito profundas e Io, com seu equipamento perdido, afunda lentamente no fundo do mar, mas Bianca em seu Guncannon Aqua danificado o levanta de volta à superfície.

Devido ao trauma emocional que Karla sofreu durante a Guerra de Um Ano, sua mente regrediu para a de uma criança adolescente com os Remanescentes de Zeon agora tentando cuidar dela na esperança de que sua mente adulta se recuperasse. O esquadrão Acguy de Daryl segue para uma cidade controlada pela Aliança dos Mares do Sul no Sudeste Asiático para resgatar um espião, mas seu disfarce é descoberto e eles devem se defender dos Mobile Suits da ilha. Enquanto isso, o Spartan é confrontado por um Esquadrão de mobile suit da South Seas Alliance, com a ex-comandante e amante de Io, Claudia, liderando-os.

Como as tensões estão altas entre a Spartan e a South Seas Alliance, a equipe de Daryl também está tendo problemas para encontrar uma saída contra um contra-ataque do grupo de culto. Durante a batalha, vários cultistas invadem o Spartan enquanto Daryl consegue extrair o espião Zeon da ilha. Enquanto isso, Io e Bianca atacam o esquadrão de unidades Dodai YS para recuperar Claudia, mas são frustrados pelo piloto Gouf, Chow Ming. Apesar da vitória temporária, Io descobre a verdade sobre quem dirige a Aliança dos Mares do Sul.