A história de Hotarubi no Mori e gira em torno de Hotaru, uma menina que se perde em uma floresta encantada onde residem aparições. Um menino, Gin, aparece diante de Hotaru, mas ela não consegue tocá-lo com medo de fazê-lo desaparecer.
Gin é um espírito da floresta. Ele encontra Hotaru pela primeira vez quando ela era muito jovem e se perdeu na floresta. Depois de ajudá-la a sair da floresta, Hotaru afirmou que voltaria para lhe dar um presente. A partir de então, os dois se tornaram amigos íntimos e se encontr…
Quando ela tinha seis anos, Hotaru se perdeu na floresta do deus da montanha. Lá ela conheceu Gin, um espírito da floresta. Desde então, todos os verões seguintes, ela voltou à floresta para conhecer Gin.
